А правильно ли считается длительность? Но даже если нет, можно использовать Excel
Странно. По моим понятиям, если в плане работ забито прерывание, то длительность прерывания не увеличивает длительность задачи. Попробуйте сами создать задачу и прервать ее на некоторое время: ее длительность от этого не увеличится. Поэтому в вашем примере длительность задачи должна составить 5 дней. Даже если факт, что над задачей не работали, выясняется на следующий день, это не создает помеху: можно постфактум создать прерывание длиною в день, и длительность, как я говорил, останется неизменной.
А если над задачей работало несколько ресурсов, и они не работали над ней в различные дни...Тогда Project не поможет, потому что, как я замечал, ресурс не может то работать над задачей, либо не работать. Тут нужно или ставить прерывание, или пользоваться другими средствами. Например, экспортировать данные о фактических трудозатратах (для каждой задачи) в Excel и далее подсчитывать количество непустых записей в строке, соответствующих каждому дню работы над задачей.